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TCGA拥有自己的一批工具，ICGC也有自己的网站，但是需要集成良好的资源。整合越好越好（尽管事实可能不是这样，但有很多人有这个想法），使用越方便。这是由UCSC Xena今天介绍的。

首先，让我们谈谈UCSC。无论是这所学校还是该网站，它都不是生物学和医学研究人员的陌生人。

参考基因组序列，基因注释信息，重复序列信息，区域保守信息和用于数据分析的CPG岛信息都可以在UCSC FTP服务器或TableBrowser上获得。当然，您还可以读取NGS基础知识- 集合中的参考基因组和基因注释文件。 UCSC基因组浏览器是可视化基因组测序数据的地标工作。精美的图形显示，PDF图像制作，方便的在线操作，丰富的监管信息，广泛的公共数据集，独特和多样本显示等都是其功能。您还可以在本地安装UCSC基因组浏览器，以进行测序数据可视化（III）-UCSC GenomeBrowser。然后是UCSC Xena，他出场了。

UCSC XENA功能基因组浏览器是新一代的在线数据分析和可视化平台集成分析，可视化，银河系和一个。现有的1098个公共数据集的91个队列，包括TCGA，ICGC，Target，GTEX，CCLE等。因此，可以组合和比较不同的数据集。

热图方法可以显示单基因与多基因表达，突变，拷贝数变化和样品属性之间的相关性。可以对任何显示的变量（对不同表型的患者进行比较，不同基因表达的比较，突变的比较以及甲基化水平的变化）进行生存分析，以绘制KM图并计算其对患者生存的影响。热图可以用任何变量对热图进行排序，然后查看其他变量的更改。如果根据药物治疗状态进行分类，请检查基因的表达或修饰。此外，Xena还为ICGC数据门户提供了Chrome扩展名，可以将Xena的Heatmap显示屏添加到ICGC接口，但测试并不成功。

这次测试Xena插件时，我访问了ICGC的官方网站，然后再次检查了该网站，然后再次更新了该网站。幸运的是，这些变化不是特别大。可以在线使用ICGC数据库和TCGA数据库的使用。

数据库的使用主要取决于您自己的操作，仔细阅读并阅读更多文档。不要考虑它，找到想要的内容。尤其是当您第一次接触时，只需阅读小说并浏览几页即可了解它们是什么。在熟悉了几个基本操作，几种常见的数据类型和显示方法之后，无论如何修改数据库，数据库都将相同。

Xena提供的此视频为熟悉Xena的使用提供了很多帮助，其余的取决于您想解决的问题。