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1920年，集美学校水产系成立。 1958年改为福建省厦门市私立集美水产学校，直属水产部。同年，升格为集美水产学院。 1960年，改为福建省集美水产学校。 1966年停止招生。 1968年改为福建省水产学校。 1970年完全停产。 1974年，学校复学。 1980年，改为福建省集美水产学校。 2000年被认定为国家重点中专。 2003年升格为高职院校，现为省级示范性高职院校。
拥有思明、翔安2个校区，总规划面积1000亩，现有建成面积710亩。设有二级学院7个，开设专科专业38个，拥有专兼职教师760人。 2021年，福建本地招生1068人。
国家特色专业：国际商务、机电一体化技术
省级特色专业：海洋工程技术、港航管理、物流管理、水产养殖技术、智能食品加工技术
住宿条件：思明校区有八人间和十二人间，以八人间为主。部分宿舍设有私人浴室，部分则没有。翔安校区有一个六人间，有两张双层床和两张书桌，比思明校区的宿舍好很多。
国际商贸专业群为省级特色专业群。作为福建省唯一一所海洋高等职业学校，在福建省颇有知名度。此外，福建省一直有计划推动其升格为福建海洋大学。当然，现实是残酷的。高职院校升格为学士学位时，只能改为职业学士学位。即使升级为海洋大学，它仍然是厦门海洋职业大学。这并不是福建省想要的结果，所以近段时间基本没有这所高职院校升格的消息。有一说一，这所大学的渔业相关专业在中国高职院校中处于前列，学术实力确实很强。如果早期并入集美大学，今天的发展会更好。
翔安校区位于翔安区，毗邻一些高职院校，距离厦门大学翔安医院也不远。就医十分方便。周边不是很繁华，离厦门大学翔安校区也不远，没事就可以上课。思明校区位于思明区。占地面积较小，但交通十分便利。学校入口就在厦门地铁三号线站，出行十分便捷。距离厦门火车站4公里，乘坐地铁仅需10分钟。只有来到思明校区，你才能真正感受到厦门的美丽。总体来说，水产相关专业比较推荐，其他专业一般。
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