河南农业大学和安徽农业大学均是农业类高校，且都获得了本省全力支持以冲击第三轮双一流评选，但基于当前信息，河南农业大学在入选可能性上略占优势。
在国家重点实验室重组方面，河南农业大学的“小麦玉米周年两熟高效生产”实验室成功入选全国重点实验室，而安徽农业大学的“茶树种质创新与资源利用”实验室也成功重组，两者均获得了国家级科研平台的认可，但河南农业大学的农学和动物医学等学科在第四轮学科评估中表现突出，且拥有作物学一级学科国家重点学科，学科基础更为扎实。
从省级支持力度看，两所高校均被列为本省重点支持对象，但河南农业大学近年来获得了更多政策倾斜，例如有消息称其可能与河南省农科院合并，这将进一步增强其综合实力，而安徽农业大学虽在茶树种质创新领域有特色，但整体资源规模相对有限。
在学科评估和科研成果方面，河南农业大学的作物学和兽医学在第四轮学科评估中均
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获评B级，且拥有省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室，科研实力较强；安徽农业大学的园艺学和林学在学科评估中分别为B-和C级，安徽农业大学农业科学是ESI全球前1‰学科，园艺学全国第六位。虽在茶学领域有优势，但整体学科布局的竞争力稍逊于河南农业大学。
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