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数学家破解细胞噪声之谜,为更好的癌症治疗铺平道路

更新时间:作者:小小条

癌症复发的恶梦和抗生素耐药性的挑战,可能有着共同的罪魁祸首:细胞内部那无法预测的随机波动。韩国科学家通过一组精妙的数学公式,找到了控制这种生物噪声的方法,为彻底消灭顽固的癌细胞开辟了全新路径。

韩国科学技术院与浦项科技大学的联合团队最近在《自然通讯》上发表的研究,提出了一种名为噪声控制器的数学模型。这项突破性成果,首次让科学家能够在单细胞水平上精确调控蛋白质的表达,而不仅仅是控制一群细胞的平均水平。这意味着,那些试图逃脱药物治疗的异常细胞,将无处藏身。

为何平均值不够用

想象一下,如果你设定淋浴水温为40摄氏度,但实际水温在冰冷和滚烫之间剧烈波动,即使平均温度正确,你也无法舒适地洗澡。细胞面临的困境恰恰如此。

数学家破解细胞噪声之谜,为更好的癌症治疗铺平道路

即使是基因完全相同的细胞,每个细胞内的蛋白质含量也会有很大差异。这种差异源于基因表达过程中的随机性,被称为生物噪声。在癌症治疗中,这种噪声会制造出少数蛋白质含量异常的细胞,它们能够逃避化疗药物的攻击,最终导致癌症复发。同样的道理也适用于细菌,少数异常细胞能在抗生素的围剿中幸存,成为耐药菌株的起源。

传统的基因调控技术虽然能够控制细胞群体的平均蛋白质水平,但往往会放大细胞之间的差异。研究团队将这种现象称为"平均值陷阱"。要真正解决问题,必须同时控制两个参数:平均值和细胞间的变异性。

数学模型的巧妙设计

研究团队设计的噪声控制器利用了两个关键的生物机制。第一个是二聚化反应,即两个相同的蛋白质分子结合成一个复合体。这个反应充当了传感器的角色,能够检测出细胞内蛋白质水平的波动。当某个细胞产生过多蛋白质时,二聚化反应会更加活跃,发出需要调节的信号。

噪声控制器 (nc) 效应的概念图:当不使用任何控制技术时(顶部,灰色),细胞群体的平均值会因外部刺激而发生变化。使用现有控制技术(中间,蓝色)后,平均值得以维持,但单个细胞之间的偏差(噪声)仍然较大。相比之下,使用噪声控制器(底部,绿色)既能维持平均值,又能降低单个细胞的噪声水平。图片来源:Nature Communications (2025)。DOI:
10.1038/s41467-025-67736-y

但仅仅检测到问题还不够,还需要快速的响应机制。研究团队将二聚化传感器与基于降解的驱动系统结合,这种系统能够迅速分解过量的蛋白质。两个机制协同工作,实现了"噪声鲁棒完美适应",即无论外部环境如何变化,都能将细胞间的差异维持在最低水平。

通过这个模型,研究团队将细胞间蛋白质含量的变异性降低到法诺系数为1。法诺系数是衡量生物噪声强度的标准指标,定义为方差与平均值的比值。法诺系数为1代表了通用生物系统所能达到的理论最低噪声水平,相当于将随机波动压缩到物理学允许的极限。

从理论到实际应用

为了验证这个数学模型的有效性,研究团队将其虚拟应用于大肠杆菌的DNA修复系统。在正常情况下,大肠杆菌细胞之间修复蛋白的含量差异很大,导致大约20%的细胞因为修复蛋白不足而在DNA损伤后死亡。

当研究人员将噪声控制器模型应用到这个系统中,通过数学优化统一所有细胞的修复蛋白水平,细胞死亡率大幅下降至7%。这意味着仅凭数学原理的指导,就能将细胞存活率提高近两倍。更重要的是,这种改进不需要开发新药物或基因改造,而是通过精巧的调控网络设计实现的。

这项研究的潜在应用前景极为广阔。在癌症治疗领域,如果能够控制肿瘤细胞内关键蛋白的表达噪声,就可以阻止那些表达水平异常的细胞逃避化疗。在合成生物学中,降低噪声意味着工程菌株能够更稳定地生产目标产物,提高生物制造的效率和可靠性。

超越传统控制范式

这项研究的真正意义在于,它将细胞噪声从过去被认为是运气或巧合的现象,转变为可以精确控制的因素。就像工程师能够设计精密机械来消除振动一样,生物学家现在也有了设计基因回路来消除细胞噪声的数学工具。

领导这项研究的金在京教授指出,这种单细胞精确控制技术将在需要精准细胞操纵的领域发挥关键作用。从克服癌症治疗的耐药性,到开发能够在极端环境下稳定工作的智能微生物,这些应用都将受益于噪声控制的数学原理。

研究团队下一步计划将这个理论模型转化为实际的基因回路,在真实的细胞系统中验证其效果。如果成功,这将标志着合成生物学进入一个全新的时代,人类将拥有前所未有的能力来精确操控生命系统的行为。

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