山东农业大学和河南农业大学都是第三轮“双一流”评选的有力竞争者，以下从关键竞争指标进行客观比较。
在院士新增数量方面，河南农业大学表现突出，连续三届新增两院院士（2021年许为钢、2023年康相涛、2025年范国强），研究领域覆盖小麦育种、禽类研究和林业等；而山东农业大学在最近三届院士评选中无人入选。
在国家科技奖励方面，山东农业大学成绩更优，2023年获得国家技术发明奖二等奖和国家科技进步奖一等奖、二等奖，2025年有2项成果通过国家科技进步奖初评；河南农业大学2023年获1项国家科技进步奖二等奖，2025年有1项通过初审。
在学科评估和ESI表现上，山东农业大学的作物学在第五轮学科评估中获评A-，并拥有ESI千分之一学科；河南农业大学的作物学和兽医学等学科位居全省前列，第六轮评估有望获得A类突破。
省级支持力度方面，山东省明确支持山东农业大学作为省属高校唯一冲击双一流目标，河南省则支持河南农业大学和河南师范大学，但河南农业大学被列前位。
综合来看，两校各有优势：河南农业大学在院士资源上领先，山东农业大学在国家科技奖励和省级重点支持上占优，学科实力接近，最终结果取决于2027年评选时的具体表现。
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